Amélioration des capacités fermentaires de Clostridium acetobutylicum par co-culture

À travers différents programmes de recherche, IFP Energies nouvelles s’implique fortement dans la mise au point de procédés de production de biocarburants et d’intermédiaires chimiques biosourcés. Le département Biotechnologie s’intéresse en particulier aux voies biologiques de production de ces bioproduits via l’utilisation de micro-organismes tels que Clostridium acetobutylicum. 
L’association de plusieurs micro-organismes en co-cultures est une thématique émergente prometteuse pour l’amélioration des performances de tels procédés. Celle-ci permettrait par exemple d’augmenter les rendements fermentaires en favorisant l’assimilation de substrats complexes et en minimisant la production de co-produits. Ces co-cultures peuvent encore être améliorées par des approches de génie génétique qui ont déjà prouvé leur efficacité pour la modification rationnelle des micro-organismes employés. 
Dans une optique d’amélioration de procédés biologiques de conversion de la biomasse renouvelable en métabolites d’intérêt pour la chimie biosourcée, la présente offre de thèse se propose d’évaluer le potentiel de diverses co-cultures impliquants C. acetobutylicum. Pour ce faire, le ou la doctorante mettra en œuvre au laboratoire les différentes méthodes nécessaires à l’étude de micro-organismes, seuls ou en co-cultures, et emploiera des outils génétiques et des techniques de pointe pour optimiser ces associations. Le (la) candidat(e) retenu(e) devra avoir un niveau ingénieur et/ou master recherche avec une spécialisation en biotechnologie et microbiologie. 

Mots clefs : Clostridium acetobutylicum, Fermentation, CRISPR-Cas9, co-culture

• Directeur de thèse    Dr. BEN CHAABANE Fadhel, Département Biotechnologie, IFPEN.https://orcid.org/0000-0002-6725-1061
• École doctorale    ED 435 ABIES (Agriculture Alimentation BIologie Environnement Santé) http://www2.agroparistech.fr/abies/
• Encadrant IFPEN    Dr. WASELS François, Ingénieur de recherche, Département Biotechnologie, IFPEN.francois.wasels@ifpen.fr https://orcid.org/0000-0002-4641-0270
• Localisation du doctorant    IFPEN, département Biotechnologie, 92500, Rueil-Malmaison, France 
• Durée et date de début    3 ans, début au cours du quatrième trimestre 2023
• Employeur    IFPEN, Rueil-Malmaison, France
• Qualifications    Master 2 (Biotechnologie, Microbiologie, Biologie Moléculaire) ou équivalent école d’ingénieur
• Connaissances linguistiques    Bonne maîtrise du français et/ou de l’anglais